(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210709182.4 (22)申请日 2022.06.21 (71)申请人 中国热带农业科 学院南亚热带作物 研究所 地址 524091 广东省湛江市麻章区湖秀路1 号 (72)发明人 吴彩玉　肖熙鸥　林文秋　欧雄常　 冯恩友　 (74)专利代理 机构 深圳市铭粤知识产权代理有 限公司 4 4304 专利代理师 孙伟峰 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一组与茄子花数量紧密连锁的SNP分子标记 及其应用 (57)摘要 本发明提供了一组与茄子花数量紧密连锁 的SNP分子标记及其应用， 本发明对茄子花数量 调控基因进行QTL定位， 并筛选到与花数量调控 基因紧密连锁的分子标记位点， 为1号染色体第 95482695和第95503318SNP位点， 两标记间的物 理距离为2 0.6Kb。 通过两个分子标记可以预测茄 子花数量， 为茄子高产品种选育种的早期鉴定和 筛选提供分子辅助选择技术支持， 同时大大缩短 了传统基因定位时间、 减少育种工作量和提高育 种效率。 权利要求书1页 说明书6页 序列表2页 附图5页 CN 115011725 A 2022.09.06 CN 115011725 A 1.一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记， 其特征在于所述SNP分子标记 包括： SNP分子标记 Ⅰ和SNP分子标记II， SNP分子标记 Ⅰ位于茄子1号染色体的第95482695， SNP分子标记I I位于茄子1号染色体第95 503318位。 2.根据权利要求1所述的一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记， 其特征 在于所述茄子一号染色体第95482695位碱基为T或C， 茄子一号染色第95503318位碱基为G 或T。 3.根据权利要求1所述的一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记， 其特征 在于所述茄子1号染色体的第95482695位碱基上下游各50个碱基序列如SEQ  ID NO:1或SEQ   ID NO:2所示； 所述茄子1号染色体的第95503318位碱基上下游各50个碱基序列如SEQ  ID  NO:3或SEQ  ID NO:4所示。 4.一组与茄子花数量 QTL位点紧密连锁的SNP分子标记检测方法， 包括以下步骤： (1)提取所述SNP分子标记上游的5 0个碱基序列和下游的5 0个碱基序列； (2)将步骤(1)整体碱基序列中的SNP分子标记通过引物设计软件转 化为KASP标记； (3)将步骤(2)中的整体碱基序列， 通过基因分型检测平台， 进行基于KASP的SNP基因分 型检测。 5.如权利要求1所述的一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记在对茄子花 数量性状进行早期鉴定和筛选中的应用， 其特征在于茄子一号染色体第95482695位碱基为 T或C， 茄子一 号染色第95 503318位碱基为G或T。 6.根据权利要求5所述的一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记在对茄子 花数量性状进 行早期鉴定和筛选中的应用， 其特征在于茄子一号 染色体第95482695位碱基 为T时， 茄子花数量为多花性状； 茄子一号染色体第95482695位碱基为C时， 茄子果花数量为 少花性状。 7.根据权利要求5所述的一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记在对茄子 花数量性状进 行早期鉴定和筛选中的应用， 其特征在于 当茄子一号 染色体第95503318位碱 基为G时， 茄子花数量为多花性状； 当茄子一号染色体第95503318位碱基为G时， 当该SNP位 点Ⅱ在等位基因中的碱基为T时， 茄子果 花数量为少花性状。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115011725 A 2一组与茄子花数量紧密连锁的SNP分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明属于茄子种资源鉴定和育种领域， 具体涉及茄子花数量紧密连锁的SNP分 子标记及其应用。 背景技术 [0002]茄子(Solanum  melongena  L)属茄科(Solanaceae)茄属(Solanum  L)重要蔬菜。 茄 子具有较强的杂种优势。 因此对已种质资源进行精准鉴定、 分类对于杂种优势的利用有着 重要的意义。 高产是茄子育种的主要目标之一。 茄子的亩产量主要由植密度、 单株结果数以 及单果重等因素决定 。 花序的形态与数量是影响茄子单株结果数的主 要因素之一。 [0003]花序的形态与数量是影响作物产量主要因素之一。 已有的研究表明， 通过提高花 序的数量能够显著提高农作物的产量， 因此花序的结构和数量的形成机制越来越受到关 注。 我们对300多份种茄子质资源进行调查， 结果表明茄子花序数量具有丰富的遗传多样 性， 其产量与花数量的多少密切相关。 [0004]随着高通量测序技术的成熟发展,特别是大量的SNP(单碱基扩增多态性)标记的 开发、 应用高密度遗传图谱的方法开展植物性状基因定位成为挖掘植物基因的热点之一。 利用高通量测序技术开 发大量的SNP标记， 开 发性状连锁的分子标记进 行品种的初期 筛选， 达到分子辅助育种的目的， 可 大大缩短育种的周期提高育种效率。 [0005]现有技术存在的问题： 目前， 利用传统育种方法进行茄子花数量性状 的育种是较 为耗时费力的， 一般要等到茄子开花之后才能知道商品茄子的花序数量， 育种周期 较长， 期 间也需要投入较大的工作量； 并且， 进 行茄子花数量调控基因定位， 筛选紧密连锁的分子标 记， 开发与茄子花数量调控基因紧密连锁的分子标记， 建立早期辅助选择技术体系， 对提高 茄子品种的产量有重要意义， 现有技术还未有效实现。 为了解决上述问题， 在现有技术的基 础上提供了与茄子花数量紧密连锁的SNP分子标记及应用。 发明内容 [0006]本发明要解决的关键技术问题在于供与 茄子花数量紧密连锁的SNP分子标记及应 用， 本发明对茄子花数量调控基因进 行QTL定位， 并筛选到与花数量调控基因紧密连锁的分 子标记位点， 为1号染色体第95482695和第95503318SNP位点， 两标记间的物理距离为 20.6Kb。 通过两个分子标记可以预测茄子花数量， 为茄子高产品种选育种的早期鉴定和 筛 选提供分子辅助选择技术支持， 同时大大缩短了传统基因定位时间、 减少 育种工作量和提 高育种效率， 本发明采用如下技 术方案： [0007]1.一组与茄子花数量QTL位点紧密连锁的SNP分子标记， 所述SNP分子标记位于茄 子1号染色体的第95482695(SNP分子标记 Ⅰ)和第95503318(SNP分子标记II)SNP位点之间， 所述第95482695位碱基为T或C， 第95 503318位碱基为G或T。 [0008]所述茄子1号染色体的第95482695位碱基上下游各50个碱基序列如SEQ  ID NO:1 或SEQ ID NO:2所示。说　明　书 1/6 页 3 CN 115011725 A 3