(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210815775.9 (22)申请日 2022.07.12 (71)申请人 河南农业大 学 地址 450002 河南省郑州市金 水区文化路 95号 (72)发明人 李新建　李秀领　李聪　段栋栋　 韩雪蕾　王克君　乔瑞敏　 (74)专利代理 机构 郑州优盾知识产权代理有限 公司 41125 专利代理师 冉珊敏 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种鉴定确山黑猪种质资源的特异分子身 份证及其应用 (57)摘要 本发明属于猪品种鉴定领域， 涉及确山黑猪 种质资源， 特别是指一种鉴定确山黑猪种质资源 的特异分子身份证及其应用。 通过SNP分子标记 对确山黑猪品种进行研究， 采用生物信息学技术 综合分析， 并将研究结果进行初步验证， 构建确 山黑猪的品种特异性分子标记， 可简单明了地区 分确山黑猪与其他地方猪品种间的差异， 可用于 确山黑猪品种的真伪鉴定和遗传关系分析， 为确 山黑猪品种的知识产权保护提供了有效的科学 依据。 在确山黑猪品种鉴定评价时， 只需将确山 黑猪品种与已有特异性分子身份证比较 分析， 即 可确定其是否为确山黑猪品种。 这大大降低了确 山黑猪种质资源鉴定评价的时间和费用， 提高了 确山黑猪品种鉴定 评价的效率。 权利要求书2页 说明书5页 附图1页 CN 114959067 A 2022.08.30 CN 114959067 A 1.一种鉴定确山黑猪种质资源的特异分子身份证， 其特征在于： 所述SNP位点为确山黑 猪品种间等 位基因频率较高的SNP位 点集合。 2. 根据权利要求1所述的鉴定确山黑猪种质资源的特异分子身份证， 其特征在于： 所 述SNP位点位于猪参 考基因组EnsemblSscrofa  11.1版本。 3.根据权利要求2所述的鉴定确山黑猪种质资源的特异分子身份证， 其特征在于： 所述 SNP位点的集合包括CNC10010832位点、 CNC10012824位点、 CNC10012972位点、 CNC10013000 位点、 CNC10013872位点、 CNC10040563位点、 CNC10041271位点、 CNC10041332位点、 CNC10041501位点、 CNC10041536位点、 CNC10041599位点、 CNC10041838位点、 CNC10042298位 点、 CNC10060925位点、 CNC10062082位点、 CNC10062105位点、 CNC10062442位点、 CNC10062524位点、 CNC1009 0798位点、 CNC10091437位点、 CNC10091643位点、 CNC10092 360位 点、 CNC10092481位点、 CNC10092509位点、 CNC10092580位点、 CNC10130757位点、 CNC10131664位点、 CNC10133552位点、 CNC10141731位点、 CNC101419 31位点、 CNC10142249位 点、 CNC10142250位点、 CNC10151846位点、 CNC10152169位点、 CNC10152617位点、 CNC10170 559位点、 CNC101708 88位点、 CNC101708 89位点和CNC10171 158位点。 4.根据权利要求3所述的鉴定确山黑猪种质资源的特异分子身份证， 其特征在于： 所述 CNC10010832位点的突变 型为T/C、 CNC10012824位点的突变型为T/G、 CNC10012972位点的突 变型为G/A、 CNC10013000位点的突变型为A/G、 CNC10013872位点的突变型为C/T、 CNC10040563位点的突变 型为T/G、 CNC1004127 1位点的突变型为C/T、 CNC10041332位点的突 变型为T/C、 CNC10041501位点的突变型为T/C、 CNC10041536位点的突变型为C/T、 CNC10041599位点的突变 型为G/A、 CNC10041838位点的突变型为C/T、 CNC10042298位点的突 变型为C/T、 CNC10060925位点的突变型为C/T、 CNC10062082位点的突变型为A/G、 CNC10062105位点的突变 型为T/C、 CNC10062442位点的突变型为A /G、 CNC10062 524位点的突 变型为A/G、 CNC10090798位点的突变型为T/C、 CNC10091437位点的突变型为C/T、 CNC10091643位点的突变 型为G/T、 CNC10092360位点的突变型为T/C、 CNC10092481位点的突 变型为T/C、 CNC10092509位点的突变型为A/G、 CNC10092580位点的突变型为A/G、 CNC1013075 7位点的突变 型为G/A、 CNC10131664位点的突变型为C/T、 CNC10133552位点的突 变型为A/G、 CNC10141731位点的突变型为T/C、 CNC10141931位点的突变型为C/T、 CNC10142249位点的突变 型为A/G、 CNC10142250位点的突变型为 G/T、 CNC10151846位点的突 变型为G/T、 CNC10152169位点的突变型为G/C、 CNC10152617位点的突变型为G/A、 CNC10170559位点的突变 型为G/A、 CNC10170888位点的突变型为C/T、 CNC10170889位点的突 变型为T/ C、 CNC10171 158位点的突变型为C /T。 5.用于识别权利要求1 ‑4任一项所述的特异分子身份 证的基因芯片。 6.权利要求5所述的基因芯片在鉴定确山 黑猪品种中的应用。 7.根据权利要求6所述的应用， 其特 征在于， 步骤为： （1） 采集待测猪的组织样本， 并提取基因 组DNA； （2） 利用基因芯片对步骤 （1） 的基因 组DNA进行SNP分型， 获得待测猪的基因型 数据； （3） 利用PLINK软件将待检测猪的基因型数据与特异分子身份证上的SNP位点的基因型 进行合并， 再进行主成分 分析。 8.根据权利要求7所述的应用， 其特征在于： 所述步骤 （1） 中基因组DNA在A260/280的光权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114959067 A 2吸收比在1.8和2.0之间， 浓度≥5 0纳克/微升 。 9.根据权利 要求7所述的应用， 其特征在于： 所述步骤 （3） 中SNP分型的主成分分析的结 果与确山 黑猪群体的遗传距离较近， 且聚集 为一簇时， 即为确山 黑猪。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114959067 A 3