(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210706755.8 (22)申请日 2022.06.21 (71)申请人 中国水产科 学研究院黄海水产研究 所 地址 266000 山东省青岛市 市南区南京路 106号 申请人 华中科技大 学 (72)发明人 周茜　宁康　朱雪　陈松林　 (74)专利代理 机构 北京和信华成知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11390 专利代理师 申龙华 (51)Int.Cl. C12Q 1/689(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/01(2006.01) (54)发明名称 一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标记 组合和筛 选半滑舌鳎抗病个 体的方法 (57)摘要 本发明提供了一种筛选抗哈维氏弧菌病半 滑舌鳎的标记组合和筛选半滑舌鳎抗病个体的 方法， 属于水产生物技术领域。 所述标记组合包 括微生物标记和宿主基因标记； 所述微生物标记 包括Alicyclobacillus  pohliae、 Phaeobacter   inhibens和Propionibacterium  acnes； 所述宿 主基因标记包括 soat、 meso1等基因。 采用本发明 提供的标记组合和筛选方法能够区分抗病和不 抗病的半滑 舌鳎个体， 进而能够筛选抗病力强的 半滑舌鳎优质良种。 权利要求书1页 说明书5页 附图2页 CN 114990243 A 2022.09.02 CN 114990243 A 1.一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标记组合， 其特征在于， 所述标记组合包括微 生物标记和宿主基因标记； 所述微生物标记包括Alicyclobacillus  pohliae、 Phaeobacter  inhibens和 Propionibacterium  acnes； 所述宿主基因标记包括soat、 meso1、 hsd17b3、 cyp27a1、 acot1_2_4、 cyp2b、 cyp19a、 irf3、 rpc1 1、 elovl5和akt基因。 2.权利要求1所述的标记组合筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎个体的方法， 其特征在于， 包括以下步骤： 1)使用宏基因组测序方法获得候选半滑舌鳎个体肠道Alicyclobacillus  pohliae、 Phaeobacter  inhibens和Propi onibacterium  acnes三种微 生物的丰度信息； 2)使用转录组测序方法获得候选半滑舌鳎肠道组织soat、 meso1、 hsd17b3、 cyp27a1、 acot1_2_4、 cyp2b、 cyp19a、 irf3、 rpc1 1、 elovl5和akt基因的表达量信息； 3)使用步骤1)得到的三种微生物的丰度信息和步骤2)得到的宿主基因的表达量信息 构建微生物和宿 主基因组合的随机森林预测模型， 区分候选半滑舌鳎是抗病个体还是不抗 病个体。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114990243 A 2一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标记组合和筛选半滑舌 鳎抗病个体的方 法 技术领域 [0001]本发明属于水产生物技术领域， 尤其涉及 一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标 记组合和筛 选半滑舌鳎抗病个 体的方法。 背景技术 [0002]半滑舌鳎(Cynoglossus  semilaevis)隶属于鲽形目、 舌鳎科、 舌鳎属， 是我国重要 的海水经济养殖鱼类， 其味道鲜美， 营养价值高， 深受广大消费者喜爱。 然而， 近年来， 随着 半滑舌鳎养殖业的迅速发展， 缺乏优良品种、 种质退化等问题突出； 同时， 养殖规模的扩大、 养殖模式集约化程度的提高导致养殖病害频繁发生， 尤其是以哈维氏弧菌为代表的细菌性 病原引发的感染性弧菌病， 导致半滑舌鳎苗种 死亡率高达50％～90％， 严重阻碍了半滑舌 鳎养殖产业的绿色可持续发展。 抗生物等药物在一定程度上可以防治病害， 但长期使用可 能引起耐药性并造成环境污染， 进而影响人类健康。 因此， 开展半滑舌鳎抗病免疫的分子机 制研究， 筛选抗病优良种质， 进而培育抗病高产新品种， 对于 半滑舌鳎养殖产业的发展至关 重要。 [0003]近年来， 在半滑舌鳎中陆续开展了抗病功能基因鉴定及表达模式分析、 抗哈维氏 弧菌病性状GWAS分析、 转录组比较等研 究， 鉴定了一系列抗病相关SNP位点、 差异表达基因 和免疫相关的代谢通路， 研究结果显示半滑舌鳎抗哈维氏弧病性状是由微效多基因调控的 复杂性状， 免疫通路基因、 信号转导分子、 代谢相关基因、 细胞因子等均参与调控半滑舌鳎 的抗病和免疫反应。 研究显示， 肠道菌群与鱼类的疾病发展、 免疫系统响应之间具有密切联 系， 同时， 肠道菌群的结构和组成也是重要的疾病诊断指标。 因此， 开展半滑舌鳎抗病相关 基因表达调控、 肠道菌群差异和宿 主‑菌群相互作用研究， 寻找并应用能够准确区分半滑 舌 鳎抗病和不抗病个体的肠道微生物和宿 主基因生物标记， 在半滑舌鳎抗病种质筛选和良种 培育中具有重要的研究意 义和应用价 值。 发明内容 [0004]有鉴于此， 本发明的目的在于提供一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标记组合 和筛选半滑舌鳎抗病个体的方法， 采用本发明提供的标记组合和筛选方法能够区分抗病和 不抗病的个 体， 进而能够筛 选抗病力强的半滑舌鳎优良种质。 [0005]为了实现上述发明目的， 本发明提供了以下技 术方案： [0006]本发明提供了一种筛选抗哈维氏弧菌病半滑舌鳎的标记组合， 所述标记组合包括 微生物标记和宿主基因标记； [0007]所述微生物标记包括Alicyclobacillus  pohliae、 Phaeobacter  inhibens和 Propionibacterium  acnes； ； [0008]所述宿主基因标记包括soat、 meso1、 hsd17b3、 cyp27a1、 acot1_2_4、 cyp2b、 cyp19a、 irf3、 rpc1 1、 elovl5和ak基因。说　明　书 1/5 页 3 CN 114990243 A 3