(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210687320.3 (22)申请日 2022.06.17 (71)申请人 江西农业大 学 地址 330045 江西省南昌市昌北 经济技术 开发区方志敏大道1 101号 (72)发明人 毛辉荣　周明芳　刘三凤　胡晓龙　 陈彪　席苏望　吴康琦　郭志豪　 吴有平　黄燕明　郭海宁　刘水兵　 王纪开　王睿涵　唐傲晗　张伟灿　 史佳玉　聂嘉良　 (74)专利代理 机构 北京东方盛凡知识产权代理 事务所(普通 合伙) 11562 专利代理师 王宁宁 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01)C12N 15/11(2006.01) G16B 20/20(2019.01) G16B 30/00(2019.01) (54)发明名称 一种用于鉴别泰和乌鸡品种的SNP分子标记 及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种用于鉴别泰和乌鸡品种 的SNP分子标记及其应用， 涉及品种鉴别领域。 本 发明提供了一种用于鉴别泰和乌鸡和非泰和乌 鸡品种的SNP分子标记、 引物组和试剂盒， 本发明 还提供了得到 所述SNP分子标记的方法及根据所 述的SNP分子标记、 所述的引物组或所述的试剂 盒在鉴别泰和乌鸡和非泰和乌鸡品种或产品中 的应用。 本发明鉴别的13个SNP位点能够精确区 分泰和乌鸡和白绒乌骨鸡、 竹丝鸡配套系及其它 中国地方乌骨鸡群体， 同时还兼顾了西方肉鸡和 蛋鸡配套系和中国地方 非乌骨鸡群体。 本发明中 鉴别的泰和乌鸡特异性分子标记位点标记的数 目有限， 为应用过程中待测个体或产品样本的检 测分型提供了 便利。 权利要求书2页 说明书14页 序列表10页 附图2页 CN 114921572 A 2022.08.19 CN 114921572 A 1.一种用于鉴别 泰和乌鸡的SNP 分子标记， 其特征在于， 所述SNP分子标记的SNP位点位 于： 鸡全基因组中1号染色体上的第124647615位、 第132371827位、 第132838411位、 第 133376355位和第133155027位； 3号染色体上的第 40090381位和第40137563位； 4号染色体 上的第75746999位和第75777777位； 5号染色体上的第3753469位； 13号染色体上的第 18166784位、 第182 29694位和第183 37506位。 2.根据权利 要求1所述的SNP分子标记， 其特征在于， 当所述SNP分子标记用于鉴别 泰和 乌鸡时， 位于鸡全基因组中1号染色体上的第124647615位的优势碱基为G、 第132371827位 的优势碱基为T、 第132838411位的优势碱基为T、 第133376355位的优势碱基为T和第 133155027位的优势碱基为C； 位于鸡全基因组中3号染色体上第40090381位的优势碱基为T 和第40137563位的优势碱基为A； 位于鸡全基因组中4号染色体上第75746999位的优势碱基 为T和第75777777位的优势碱基为G； 位于鸡全基因组中5号染色体上第3753469位的优势碱 基为T； 位于鸡全基因组中13号染色体上第18166784位的优势碱基为A、 第18229694位的优 势碱基为C以及第183 37506位的优势碱基为T。 3.根据权利 要求1所述的SNP分子标记， 其特征在于， 当所述SNP分子标记用于鉴别非泰 和乌鸡时， 位于鸡全基因组中1号染色体上的第124647615位的优势碱基为A、 第132371827 位的优势碱基为C、 第132838411位的优势碱基为G、 第133376355位的优势碱基为C和第 133155027位的优势碱基为G； 位于鸡全基因组中3号染色体上第40090381位的优势碱基为C 和第40137563位的优势碱基为G； 位于鸡全基因组中4号染色体上第75746999位的优势碱基 为C和第75777777位的优势碱基为A； 位于鸡全基因组中5号染色体上第3753469位的优势碱 基为G； 位于鸡全基因组中13号染色体上第18166784位的优势碱基为G、 第18229694位的优 势碱基为A以及第183 37506位的优势碱基为G。 4.一种用于分别扩增权利要求1中所述的SNP分子标记的引物组， 其特征在于， SEQ  ID  NO： 1和2引物对用于扩增1号染色体上包含第124647615位的基因片段； SEQ  ID NO： 3和4引 物对用于扩增1号染色体上包含第132371827位的基因片段； SEQ  ID NO： 5和6引物对用于扩 增1号染色体上包含第132838411位的基因片段； SEQ  ID NO： 7和8引物对用于扩增1号染色 体上包含第133376355位的基因片段； SEQ  ID NO： 9和10引物对用于扩增1号染色体上包含 第133155027位的基因片段； SEQ  ID NO： 11和12引物对用于扩增3号染色体上包含第 40090381位的基因片段； SEQ  ID NO： 13和14引物对用于扩增3号染色体上包含第 40137563 位的基因片段； SEQ  ID NO： 15和16引物对用于扩增4号染色体上包含第 75746999位基因片 段； SEQ ID NO： 17和18引物对用于扩增4号染色体上包含第75777777位的基因片段； SEQ  ID  NO： 19和20引物对用于扩增5号染色体上包含第3753469位的基因片段； SEQ  ID NO： 21和22 引物对用于扩增13号染色体上包含第18166784位的基因片段； SEQ  ID NO： 23和24引物对用 于扩增13号染色体上包含第18229 694位的基因片段； SEQ  ID NO： 25和26引物对用于扩增13 号染色体上包 含第18337506位的基因片段。 5.一种用于鉴别泰和乌鸡和非泰和乌鸡的试剂 盒， 其特征在于， 包含权利要求4所述的 引物组。 6.一种用于鉴别泰和乌鸡和非泰和乌鸡的方法， 其特征在于， 包括将待测样本的DNA用 权利要求1所述的SNP分子标记进行分析， 根据SNP标记的信息来 鉴别。 7.一种根据利要求1所述的SNP分子标记、 权利要求4所述的引物 组或权利要求5所述的权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114921572 A 2试剂盒在鉴别泰和乌鸡和非泰和乌鸡品种或产品中的应用。 8.根据权利要求7 所述的应用， 其特 征在于， 所述产品包括活禽、 鸡肉和鸡蛋。 9.一种得到权利要求1所述的SNP分子标记 的方法， 其特征在于， 包括将不同鸡品种提 取得到的DNA进 行全基因组重测序， 运用全基因组关联分析结合固定指数分析方法， 筛选到 所述的SNP分子标记； 所述乌鸡品种包括： 红色原鸡、 隐性白羽肉鸡、 白来航鸡、 白壳蛋鸡、 肉 鸡B系、 肉鸡A系、 褐壳蛋、 云南本地鸡、 西双版纳斗鸡、 旧院黑鸡、 彭县黄鸡、 米易鸡、 沐川乌 骨鸡、 金阳丝毛鸡、 峨眉黑鸡、 天府乌 骨鸡、 石棉草科鸡、 鲁西斗鸡、 辽宁百日鸡、 仙居鸡、 溧 阳鸡、 北京油鸡、 淮北麻鸡、 五华黄鸡、 杏花鸡、 惠阳胡须鸡、 怀乡鸡、 麒麟鸡、 正阳三黄鸡、 浙 川乌骨鸡、 宁都黄鸡、 广丰白耳黄鸡、 余干乌骨鸡、 修水黄羽乌鸡、 泰和乌鸡、 崇仁麻鸡、 康 乐 黄鸡、 安义瓦灰鸡、 东乡绿壳 蛋鸡、 象洞鸡、 德化 黑鸡、 河田鸡、 白绒乌骨鸡和竹丝鸡。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114921572 A 3