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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211029719.9 (22)申请日 2022.08.25 (71)申请人 成都医学院 地址 610036 四川省成 都市金牛区蓉都大 道天回路6 01号 (72)发明人 王频佳 谢成彬 (74)专利代理 机构 成都金英专利代理事务所 (普通合伙) 51218 专利代理师 徐立宁 (51)Int.Cl. C12Q 1/686(2018.01) C12Q 1/6806(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检 测阳性对照的方法 (57)摘要 本发明公开了同时制备多种病毒RNA片段用 作核酸检测阳性对照的方法。 所述方法包括以下 步骤: 体外合成多种待检测病毒的保守区核苷酸 序列, 将各序列分别插入到质粒载体中, 获得含 有病毒保守序列的重组质粒; 以所述各病毒的保 守序列作为靶序列设计用于PCR扩增的特异性引 物对; 设计并合成一对非特异性通用引物, 其中 正义引物含有T7 RNA聚合酶的同源启动子序列; 将通用引物与各病毒特异性引物相连, 形成针对 各种待检测病毒的嵌合引物对; 以重组质粒为模 板, 采用Tem ‑PCR技术, 使用多对嵌合引物和一对 通用引物进行病毒核酸的扩增; 基于体外转录技 术将多重PCR的产物转录为RAN片段。 本发明操作 简单, 成本低廉, 可同时制备多种病毒保守区序 列RNA片段。 权利要求书2页 说明书12页 附图3页 CN 115418396 A 2022.12.02 CN 115418396 A 1.一种同时制备多种 病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 包括以下步骤: 体外合成多种待检测病毒的保守区核苷酸序列, 将各序列分别插入到质粒载体中, 获 得含有病毒保守序列的重组质粒, 作为后续PCR的模板; 以所述多种待检测病毒的保守序列 作为靶序列设计用于PCR扩增的特异性引物对; 设计并合成一对非特异性通用引物, 并保证该非特异性通用引物对与待测病 毒无同源 性, 所述非特异性通用引物的正义引物为含有T7 RNA聚合酶的同源启动子序列, 即5' ‑ TAATACGACTCACTATAG GG ‑3'; 合成所述多种待检测病毒的嵌合引物对; 以重组质粒为模板, 采用Tem ‑PCR技术, 将多对嵌合引物和一对通用引物进行病毒核酸 的扩增, 获得PCR产物; 以上述PCR产物作为体外转录模板, 将DNA转录为RNA; 将RNA储存在‑20°C~‑70°C备用。 2.根据权利要求1所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 所述多种待检测病毒包括: A组轮状病毒、 诺如病毒GI型、 诺如病毒GII型、 星状 病毒和札如病毒。 3.根据权利要求1所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 所述质粒 载体包括pUC 57载体。 4.根据权利要求1所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 所述非特异性 通用引物的反义引物序列为SEQ ID No .1。 5.根据权利要求1所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 还 包括对转录 本进行纯化的步骤, 以便除掉模板、 核苷酸和蛋白质。 6.根据权利要求5所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 所述嵌合引物是将非特异 性通用引物的正义引物和反义引物分别与所述病毒 的特异性引物对中的正 义引物和反义引物的5 ’端相连, 形成碱基数目为3 5~40nt的长引物。 7.根据权利要求6所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 每一对嵌合引物5 ’端都带有一个能被通用引物识别的标签序列, 所有正义嵌 合引物的5 ’端的标签序列为含有 T7 RNA聚合酶的同源启动子序列。 8.根据权利要求1所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 扩增后Tem ‑PCR的主要成分包括PCR Mix Buffer、 通用引物对、 多种待检测病 毒的嵌合引物对, 多种病毒的重组质粒和ddH2O; 所述PCR Mix Buffer为2 ×PCR Mix Buffer或10×PCR Mix Buffer。 9.根据权利要求8所述一种同时制备多种病 毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法, 其特征在于, 所述嵌合引物和通用引物的摩尔浓度比为1: 2~5。 10.根据权利要求9所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述嵌合引物和通用引物的摩尔浓度比为1: 5 。 11.根据权利要求1所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述Tem ‑PCR的扩增条件为: 第一步: 94℃ 30s, 55~58℃ 15s, 72℃ 60s, 扩增反应15个 循环; 第二步: 94℃ 30s, 72℃ 90s, 扩增反应6个 循环;权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115418396 A 2第三步: 94℃ 20s, 46℃ 20s, 72℃ 20s, 扩增反应3 5个循环。 12.根据权利要求1所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述PCR产物体外转录含有: 20 μl 体外转录体系中含有: 5X TranscriptAid Reaction Buffer 4 μl、 ATP/CTP/ GTP/UTP mix 8 μl或Transcript Aid Enzyme Mix 2 μl; PCR产物或胶回收产物 2 μl; DEPC 处理水2 μl; 反应条件: 37 °C孵育2小时。 13.根据权利要求2所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述A组轮状病毒的嵌合引物对: 正义引物序列为SEQ ID No .2, 反义引物 序列为SEQ ID No .3。 14.根据权利要求2所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述诺如病毒GI型的嵌合引物对: 正义引物的序列为SEQ ID No .4, 反义 引物序列为SEQ ID No .5。 15.根据权利要求2所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述诺如病毒GII型的嵌合引物对: 正义引物序列为SEQ ID No .6; 反义引 物序列为SEQ ID No .7。 16.根据权利要求2所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述星状病毒的嵌合引物对: 正义引物序列为SEQ ID No .8反义引物序列 为SEQ ID No .9。 17.根据权利要求2所述一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方 法, 其特征在于, 所述札如病毒的嵌合引物对: 正义引物序列为SEQ ID No .10, 反义引物序 列为SEQ ID No .11。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115418396 A 3
专利 一种同时制备多种病毒RNA片段用作核酸检测阳性对照的方法
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