(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210602863.0 (22)申请日 2022.05.30 (71)申请人 中国农业科 学院兰州畜牧与兽药研 究所 地址 730050 甘肃省兰州市七里河区硷沟 沿335号 (72)发明人 郭婷婷　袁超　刘建斌　卢曾奎　 岳耀敬　牛春娥　李建烨　孙晓萍　 马炳洁　杨博辉　 (74)专利代理 机构 北京力量专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 11504 专利代理师 毛婷 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01)C12Q 1/6837(2018.01) (54)发明名称 一种与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关 的SNP位点组合及其应用 (57)摘要 本发明属于生物 技术领域， 具体涉及一种 与 细毛羊羊毛纤维直径 变异系数相关的SNP位点组 合及应用。 本发 明提供了与细毛羊羊毛纤维直径 变异系数相关的21个SNP位点组合； 本发明提供 了检测SNP位点组合的基因型的试剂在检测细毛 羊羊毛纤维直径变异系数或细毛羊分子标记辅 助育种中的应用； 以及基于该位点组合形成的分 子探针组合、 基因芯片、 试剂盒， 利用本发明提供 的位点组合及分子探针组合、 基因芯片、 试剂盒 能对细毛羊个体的羊毛纤维直径变异系数进行 分析， 对早期 难以度量的细毛羊羊毛纤维直径变 异系数性状进行个体选择， 缩短世代间隔， 加速 育种进程， 节约育种成本， 为今后细毛羊的鉴定、 保种及遗传育种提供支撑 。 权利要求书1页 说明书24页 附图1页 CN 114959059 A 2022.08.30 CN 114959059 A 1.一种与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的21个SNP位点组合， 其特征在于， 所述21 个SNP位点组合基于绵羊v4.0基因组序列比对确定； 分别为： 位于chr  1第217783263位， 其 脱氧核苷酸为C或G； 位于chr  5第93384120位， 其脱氧核苷酸为 G或A； 位于chr  5第93388756 位， 其脱氧核苷酸为G或C； 位于chr  5第93404769位， 其脱氧核苷酸为T或C； 位于chr  5第 93406719位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr  6第38408895位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于 chr 6第111748267位， 其脱氧核苷酸为T或G； 位于chr  6第111748269位， 其脱氧核苷酸为T 或A； 位于chr  12第25149517位， 其脱氧核苷酸为C或A； 位于chr  13第76808776位， 其脱氧核 苷酸为T或C； 位于chr  14第7905177位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr  17第66866538位， 其 脱氧核苷酸为C或G； 位于chr  17第66866548位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  17第 66883407位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  18第29852011位， 其脱氧核苷酸为A或T； 位于 chr 21第3968 1097位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  21第39681575位， 其脱氧核苷酸为C 或T； 位于chr  21第39691901位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr  21第39712741位， 其脱氧核 苷酸为C或T； 位于chr  21第39713282位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr21第39715270位， 其 脱氧核苷酸 为G或A。 2.检测权利要求1所述与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的21个SNP位点组合的试 剂在检测与细毛羊 羊毛纤维直径变异系数或在 细毛羊分子标记辅助育种中的应用。 3.如权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述试剂包括用于检测所述SNP位点组合的 分子探针组合。 4.一种分析细毛羊羊毛纤维直径变异系数性状的分子探针组合， 其特征在于， 所述分 子探针组合检测如权利要求1中所述的与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的21个SNP位 点组合。 5.一种分析细毛羊羊毛纤维直径变异系数性状的基因芯片， 其特征在于， 所述基因芯 片负载有权利要求 4所述的分析细毛羊 羊毛纤维直径变异系数性状的分子 探针组合。 6.一种分析细毛羊羊毛纤维直径变异系数性状的试剂盒， 其特征在于， 所述试剂盒包 括权利要求4所述的分析细毛羊羊毛纤维直径变异系 数性状的分子探针组合或权利要求5 所述的分析细毛羊 羊毛纤维直径变异系数性状的基因芯片。 7.如权利要求4所述的分子探针组合， 或权利要求5所述的基因芯片， 或权利要求6所述 的试剂盒在细毛羊羊毛纤维直径变异系 数性状评价， 或在细毛羊品种筛选， 或在细毛羊品 种鉴定， 或在 细毛羊分子标记辅助育种中的应用。 8.分析细毛羊羊毛 纤维直径变异系数性状的方法， 其特征在于， 所述方法为： 检测待测 细毛羊的基因组DNA中如权利要求 1所述的与细 毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的21个SNP 位点基因型； 对照细毛羊基因组DNA的所述21个SNP位点基因型进行比较， 根据基因型检测 结果判断细毛羊的羊毛纤维直径变异系数性状。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114959059 A 2一种与细毛羊 羊毛纤维直径变异系数相关的SNP位点组合及 其应用 技术领域 [0001]本发明属于生物技术领域， 具体涉及一种与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的 SNP位点组合及应用。 背景技术 [0002]绵羊(Ovis  aries)是最有经济价值的驯化物种之一， 可为人类社会提供肉、 皮、 毛 以及奶， 是全球农业经济的重要组成部 分。 除了能为人类社会提供必须的羊肉外， 绵羊更是 动物纤维产业的宝贵资源。 相对于其他牲畜品种， 主要为生产羊毛而饲养的细毛羊的遗传 改良缓慢， 在经济意义上重要的那些性状中， 大多 数具有中高遗传力， 并且易于测量且成本 低廉， 达到足以精确用于动物遗传评估的水平。 对于测量困难或昂贵的少数性状中， 研究人 员已证明羊毛纤维直径的变异系数可带来显著的收益。 大多 数国家都有高效的评估方法和 完善的工具， 如利用BLUP方法进行指数选择等。 [0003]在绵羊的众多分类中， 细毛羊是毛用羊品种之一， 其羊毛性状 的选育提高和改良 在羊毛加工产业中具有重要的意义。 羊毛纤维的线密度与各项物理性能关系很大。 一般羊 毛越细， 它的线密度就较均匀， 强度较高， 卷曲多， 鳞片密， 光泽柔和， 油汗含量高， 但长度偏 短。 因此线密度是决定羊毛品质好坏的重要指标。 其中， 常用的表 示羊毛线密度的指标有平 均直径、 品质支数和特克斯数。 如能求得纤维直径根数分布， 可用纤维直径变异系数来表 示 一批羊毛的线密度不匀情况。 [0004]关于羊毛纤维及其变异系数改良的相关研究， 表明一般通过以候选基因为遗传标 记的分子标记辅助选择可加速进程。 此外， 分子标记， 尤其是单核苷酸多态性(SNP)对群体 遗传学研究很重要。 SNP基因分型技术原理主要是PCR扩增含有SNP的基因组片段， 主要特点 是准确性高、 灵活性强、 通量大， 主要方法是TapMan探针法。 近几年， SNP基因分型技术广泛 应用于家畜各重要经济性状相关的分子育种研究中。 本申请则旨在 对细毛羊的羊毛纤维直 径变异系数进 行SNP基因分型， 由此加快其分子育种进程， 达到加快对种质资源的保护与利 用的目的。 [0005]本发明首先提供了与细毛羊羊毛纤维直径变异系数相关的21个SNP位点组合， 所 述SNP位点基于绵羊v4.0基因组序列比对确定； 分别为： 位于chr  1第217783263位， 其脱氧 核苷酸为C或G； 位于chr  5第93384120位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  5第93388756位， 其脱氧核苷酸为C或C； 位于chr  5第93404769位， 其脱氧核苷酸为T或C； 位于chr  5第 93406719位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr  6第38408895位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于 chr 6第111748267位， 其脱氧核苷酸为T或G； 位于chr  6第111748269位， 其脱氧核苷酸为T 或A； 位于chr  12第25149517位， 其脱氧核苷酸为C或A； 位于chr  13第76808776位， 其脱氧核 苷酸为T或C； 位于chr  14第7905177位， 其脱氧核苷酸为C或T； 位于chr  17第66866538位， 其 脱氧核苷酸为C或G； 位于chr  17第66866548位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  17第 66883407位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  18第29852011位， 其脱氧核苷酸为A或T； 位于说　明　书 1/24 页 3 CN 114959059 A 3