(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210600476.3 (22)申请日 2022.05.30 (71)申请人 中国农业科 学院兰州畜牧与兽药研 究所 地址 730050 甘肃省兰州市七里河区硷沟 沿335号 (72)发明人 郭婷婷　袁超　刘建斌　岳耀敬　 卢曾奎　牛春娥　李建烨　孙晓萍　 马炳洁　杨博辉　 (74)专利代理 机构 北京力量专利代理事务所 (特殊普通 合伙) 11504 专利代理师 毛婷 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种与细毛羊净毛率相关的SNP位点组合及 其应用 (57)摘要 本发明属于生物 技术领域， 涉及一种 与细毛 羊净毛率相关的SNP位点组合及应用。 本发明提 供了与细毛羊净毛率相关的11个SNP位点组合， 所述SNP位点基于绵羊v4.0基因组序列比对确 定； 本发明提供了检测细毛羊基因组中与细毛羊 净毛率相关的11个SNP位点组合的基因型的试剂 在检测细毛羊净毛率或细毛羊分子标记辅助育 种中的应用； 以及基于该位点组合形成的分子探 针组合、 基因芯片、 试剂盒， 利用本发明提供的位 点组合及分子探针组合、 基因芯片、 试剂盒能对 细毛羊个体的净毛率性状进行分析， 对早期难以 度量的净毛率性状进行个体选择， 缩短世代间 隔， 加速育种进 程， 节约大量的育种成本， 为今后 细毛羊的鉴定、 保护以及分子遗传育种提供支 撑。 权利要求书1页 说明书12页 附图1页 CN 114790483 A 2022.07.26 CN 114790483 A 1.一种与细毛羊净毛率相 关的11个SNP位点组合， 其特征在于， 所述11个SNP位点组合 基于绵羊v4.0基因组序列比对确定； 分别为： 位于chr  1第46959081位， 其脱 氧核苷酸为T或 C； 位于chr  1第49921099位， 其脱氧核苷酸为C或G； 位于chr  2第45125479位， 其脱氧核苷酸 为C或A； 位于chr  7第48114170位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  11第25845229位， 其脱氧 核苷酸为C或T； 位于chr  17第17696652位， 其脱氧核苷酸为T或A； 位于chr  17第56249564 位， 其脱氧核苷酸为G或T； 位于chr  19第837291位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  21第 39667311位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  21第39691339位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于 chr 23第34296893位， 其脱氧核苷酸 为C或A。 2.检测权利要求1所述与细毛羊净毛率相关的11个SNP位点组合的试剂在检测细毛羊 净毛率性状或在 细毛羊分子标记辅助育种中的应用。 3.如权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述试剂包括用于检测所述SNP位点组合的 分子探针组合。 4.一种分析细毛羊净毛率性状的分子探针组合， 其特征在于， 所述分子探针组合检测 如权利要求1中所述的与细毛羊净毛率相关的1 1个SNP位 点组合。 5.一种分析细毛羊净毛率性状的基因芯片， 其特征在于， 所述基因芯片负载有权利要 求4所述的分析细毛羊净毛率 性状的分子 探针组合。 6.一种分析细毛羊净毛率性状的试剂 盒， 其特征在于， 所述试剂 盒包括权利要求4所述 的分析细 毛羊净毛率性状的分子探针组合或权利要求5所述的分析细毛羊净毛率性状的基 因芯片。 7.如权利要求4所述的分子探针组合， 或权利要求5所述的基因芯片， 或权利要求6所述 的试剂盒在细 毛羊净毛率性状评价， 或在细 毛羊品种筛选， 或在细 毛羊品种鉴定， 或在细 毛 羊分子标记辅助育种中的应用。 8.分析细毛羊净毛率性状的方法， 其特征在于， 所述方法为： 检测待测细毛羊的基因组 DNA中如权利要求1所述的与细毛羊净毛率相关 的11个SNP位点基因型； 对照细毛羊基因组 DNA的所述1 1个SNP位 点基因型进行比较， 根据基因型检测结果判断细毛羊的净毛率 性状。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114790483 A 2一种与细毛羊 净毛率相关的SNP位点组合及其应用 技术领域 [0001]本发明属于生物技术领域， 具体涉及一种与细毛羊净毛率相关的SNP位点组合及 应用。 背景技术 [0002]绵羊(Ovis  aries)作为有史以来最早被驯化的动物之一， 在人类社会中发挥了重 要作用， 并且通过人类迁徙几乎在 全球范围内繁衍。 人类对羊进 行驯化用于饲养， 主要是为 了满足人类社会的生存需要， 尤其是对于生活在偏远和游牧地区的人民。 随着人们生活水 平的提高和物质需求的不断丰富， 细 毛羊因生产羊毛等次要产品成为了绵羊经济生产性能 分类之一， 其培 育的专业 化出现了 。 [0003]细毛羊以其生产优质羊毛而闻名， 羊毛作为一种 天然纤维， 是用于服装和纺织品 的重要农产品。 其中， 羊毛质量由纤维直径、 纤维长度、 净毛率、 卷曲、 颜色和髓质百分比决 定。 细毛羊的羊毛性状一直是人工选育的重点。 在众多羊毛性状中， 净毛率在羊毛流通领域 中是羊毛交易计算重量与价格的重要依据， 且在养羊业生产上测定和统计羊群与个体的产 毛量时， 都以净毛量为基础。 但由于细毛羊的被毛 是完全由无髓细 毛组成的同质细 毛， 细度 在60支以细， 即羊毛纤维直径在25微米以下， 因此细 毛羊的净毛率是普遍偏低， 严重影响羊 毛经济价值。 但目前对于细毛羊净毛率的研究较少， 因此本发明旨在利用已被广泛应用的 分子遗传标记方法， 对细毛羊净毛率相关的遗传性状进行探究。 [0004]分子标记是以直接检测D NA核苷酸序列的差异为基础的遗传标记。 目前D NA分子标 记已被广泛应用， 主要 可以分为三大类： 第一类是以分子杂交为核心的第一代分子标记， 包 括了限制片段多态 性RELP， DNA指纹技术等； 第二类是以P CR为核心的第二代分子标记， 包括 随机扩增 多态性RAPD， 简单序列重复SSR， 扩增片段长度多态性AFLP， 序列标签位点STS等； 第三类则是新型的分子标记， 同样以PCR技术为基础， 包括了单核苷 酸多态性SNP标记， 表达 序列标签EST等。 其中， 由于从SNP多态 性数据中可以通过计算 获得准确的育种值， 因此本申 请选择采用应用SNP位 点组合的检测来加速对细毛羊净毛率 性状的改进。 [0005]本发明首先提供了与细毛羊净毛率相关的11个SNP 位点组合， 所述S NP位点基于绵 羊v4.0基因组序列比对确定； 分别为： 位于chr  1第46959081位， 其脱氧核苷酸为T或C； 位于 chr 1第49921099位， 其脱氧核苷酸为C或G； 位于chr  2第45125479位， 其脱氧核苷酸为C或 A； 位于chr  7第48114170位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  11第25845229位， 其脱氧核苷 酸为C或T； 位于chr  17第17696652位， 其脱氧核苷酸为T或A； 位于chr  17第56249564位， 其 脱氧核苷酸为 G或T； 位于chr  19第837291位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  21第39667311 位， 其脱氧核苷酸为A或G； 位于chr  21第39691339位， 其脱氧核苷酸为G或A； 位于chr  23第 34296893位， 其脱氧核苷酸为C或A。 其次， 本发明通过GenoPlexs(基于多重PCR 的靶向基因 捕获技术方案)和GenoBaits(基于液相探针杂交的靶向基因捕获技术方案)技术， 获得目标 SNP的基因型， 实现了细 毛羊净毛率性状的快速有效检测， 对绵羊的分子育种以及种质资源 的保护与改造均有着重要的意 义。说　明　书 1/12 页 3 CN 114790483 A 3